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利用psi4提交能量后,交其他作业报错

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发布时间: 2024-4-23 09:54

正文摘要:

各位老师好,我安装完psi4后,使用自己的账户计算150个原子的能量分解,但是发生了报错;我后面去交高斯作业时,作业不能提交了,看了下存储空间,发现内存占满了,想问下这种情况要怎么解决呢?

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wanan 发表于 Post on 2024-4-23 21:08:37
zjxitcc 发表于 2024-4-23 16:29
如果有定义PSI4临时文件路径,则运行echo $PSI_SCRATCH可获得具体路径;如果没定义,那一般来说在/tmp/ ...

嗯嗯,已经解决了,谢谢
zjxitcc 发表于 Post on 2024-4-23 16:29:03
wanan 发表于 2024-4-23 16:23
好的老师,想问一下这个临时文件是放在哪里呢?


如果有定义PSI4临时文件路径,则运行echo $PSI_SCRATCH可获得具体路径;如果没定义,那一般来说在/tmp/,或$TMP/,或$TMPDIR/下。查一下这几个路径占用的硬盘空间就知道了。如果不知道我在说什么,说明需要恶补一点Linux基本操作技巧。
另外,自己在PSI4输出文件里找找,应该也是能找到的。注意,不是/home/conda那一串路径。

wanan 发表于 Post on 2024-4-23 16:23:45
sobereva 发表于 2024-4-23 10:01
分清楚内存和硬盘
倘若PSI4和Gaussian的临时文件储存的分区是同一个,显然PSI4的临时文件把硬盘写满(并且 ...

好的老师,想问一下这个临时文件是放在哪里呢?
sobereva 发表于 Post on 2024-4-23 10:01:46
分清楚内存和硬盘
倘若PSI4和Gaussian的临时文件储存的分区是同一个,显然PSI4的临时文件把硬盘写满(并且导致PSI4崩溃)了,Gaussian占硬盘的任务就没法跑了。自己把PSI4的临时文件删了就完了。
这么大体系强烈不建议用SAPT,极其昂贵而且占硬盘/内存相当大,而且至多用SAPT0跑而其精度也不怎么样,若跑半天最后因为硬盘不够导致任务失败还白白耽误了大量时间。用sobEDA是极佳的选择,精度好,用起来方便,耗时又低,又不占多少内存和硬盘:
使用sobEDA和sobEDAw方法做非常准确、快速、方便、普适的能量分解分析
http://sobereva.com/685http://bbs.keinsci.com/thread-39446-1-1.html

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