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对抗路达摩 发表于 2024-11-19 11:18 可以啊,技术上都可以,流程上得自己研究一下,把小分子assign力场的那步换成tleap就行。 |
k64_cc 发表于 2024-10-22 13:25 这个方案可以用来跑多肽的Absolute solvation free energy吗?尤其是他那个H-REMD交换的部分? |
Serious 发表于 2024-10-23 10:08 FEP+不就是收费方案嘛,还有其他一系列算FEP的公司提供的软件/服务,都不是学术免费的。Amber可以认为是学术免费的FEP计算工具里唯一一个相对可靠的。 |
参与人数Participants 1 | eV +3 | 收起 理由Reason |
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Serious | + 3 | 谢谢 |
Serious 发表于 2024-10-23 10:08 官网有说明的哦,学术免费,商用收费 |
参与人数Participants 1 | eV +3 | 收起 理由Reason |
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Serious | + 3 | 谢谢 |
k64_cc 发表于 2024-10-22 13:25 请教下“收费方案”是怎么样子的,挺好奇hh |
本帖最后由 k64_cc 于 2024-10-22 13:27 编辑 FEP的全流程从Darrin York自行维护的仓库整个合并到主仓库去了,这意味着买了Amber的人都能得到一个质量只比收费方案差一点的计算方案(甚至不少商业化供应商后台跑的也就是这套方案 QUICK从四五年前的性价比超低(单卡P100和高斯24c速度相当),逐渐发展到现在确实提高了效率的程度,提升也颇为明显。 |
quick支持gpu了,算不算亮眼的新特性 |
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