linux系统安装gromacs时到make install一步时报错

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发布时间: 2024-5-3 13:44

本人为linux小白，ubuntu系统是最近才安装的新系统，正按照sob老师的博文http://sobereva.com/457安装gromacs，先前的步骤都严格执行的情况下，在，尝试将-j去了也一样，前面步骤除了将/sob改为我自己的目录名/roo ...

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2877321934 发表于 Post on 2024-5-4 19:22:54

sobereva 发表于 2024-5-4 17:07
2023目前的最新版

@喵星大佬感谢两位老师

喵星大佬 发表于 Post on 2024-5-4 17:13:28

2877321934 发表于 2024-5-4 12:51
@喵星大佬还有追问一下两位老师，哪个版本的gromacsGPU加速性能最好，想装个计算速度比较快的版本的grom ...

对于NV的GPU，2021以后在相同设置下几乎没有区别，22版本之后引入的一堆bug不知道修的咋样了，所以如果不用新功能就21.7，对于非NV的GPU，必须2023以后的版本，目前可以用2023.5或2024.1

sobereva 发表于 Post on 2024-5-4 17:07:47

2877321934 发表于 2024-5-4 12:51
@喵星大佬还有追问一下两位老师，哪个版本的gromacsGPU加速性能最好，想装个计算速度比较快的版本的grom ...

2023目前的最新版

2877321934 发表于 Post on 2024-5-4 12:51:33

sobereva 发表于 2024-5-3 23:52
尝试编译gmx更新的版本

@喵星大佬还有追问一下两位老师，哪个版本的gromacsGPU加速性能最好，想装个计算速度比较快的版本的gromacs

2877321934 发表于 Post on 2024-5-4 11:58:35

sobereva 发表于 2024-5-3 23:52
尝试编译gmx更新的版本

@喵星大佬感谢两位老师我去试试

喵星大佬 发表于 Post on 2024-5-4 02:32:53

ubuntu22的自带gcc11编不过gmx2018，而且为啥要用那么古老的版本。。。。要稳定版推荐2021.7，gcc11可以编出来，一定要用18的话ubuntu退回20用gcc9可以

sobereva 发表于 Post on 2024-5-3 23:52:56

2877321934 发表于 2024-5-3 21:30
系统版本为ubuntu22，gromacs版本为2018.8

尝试编译gmx更新的版本

2877321934 发表于 Post on 2024-5-3 21:30:20

sobereva 发表于 2024-5-3 20:07
说明gromacs版本、操作系统版本。操作系统自带的gcc太老会导致不兼容
Ubuntu的情况我不清楚，我也反感Ubun ...

系统版本为ubuntu22，gromacs版本为2018.8

sobereva 发表于 Post on 2024-5-3 20:07:31

说明gromacs版本、操作系统版本。操作系统自带的gcc太老会导致不兼容
Ubuntu的情况我不清楚，我也反感Ubuntu，CentOS 7、8编译2018.8不会有问题

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