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SMD COM pulling 拉伸距离突然为负值

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发布时间: 2024-5-6 16:28

正文摘要:

请教大家一个问题,最近使用GROMACS2023做蛋白质的SMD拉伸模拟,在输出的拉伸距离文件中发现拉伸点间的距离突然变为负值,如下如所示。 我猜可能是周期性边界条件的原因,如果是这个原因,该如何修正呢(使距离继续 ...

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