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胺醛缩合反应过渡态计算求助

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Friday

发布时间: 2024-5-7 10:23

正文摘要:

各位老师好，最近在计算胺醛缩合反应机制中 “质子转移过程”，遇到了一些问题，我参照的是雷鸣老师的这一篇文献“Theoretical study onnitrogenous heterocyclic assisted aldimine condensation[J]. Acta Chim. Si ...

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Friday 发表于 Post on 2024-5-15 21:42:49

mettlyz 发表于 2024-5-14 19:02
跑了一下TS2的，仅供参考。能量好像同你画的不一样。
https://alphacat.deepchem.cn/share#/detail/9d658c ...

您好，那个能量是用的我自己的反应物质跑出来了，我在搞合成的同时，用了一下雷鸣老师提出来的这个模型，我的TS2计算的时候一直有微弱的震荡，感谢您的回复

mettlyz 发表于 Post on 2024-5-14 19:02:58

本帖最后由 mettlyz 于 2024-5-14 19:07 编辑

跑了一下TS2的，仅供参考。能量好像同你画的不一样。
https://alphacat.deepchem.cn/sha ... 1d982ebdb973d2b8040

Friday 发表于 Post on 2024-5-12 21:08:00

75uio 发表于 2024-5-7 11:45
1 自由能低正常，电子能是高的。因为计算找到的是势能面上反应路径上的能量最高点。详见http://sobereva.co ...

好的，我去看看，谢谢您。

75uio 发表于 Post on 2024-5-7 11:45:51

1 自由能低正常，电子能是高的。因为计算找到的是势能面上反应路径上的能量最高点。详见http://sobereva.com/44
2 缩短步长试试，或者使用文章SI中的计算结构。

Friday 发表于 Post on 2024-5-7 10:25:18

这是参考文献

含氮杂环协助的醛胺缩合反应机理的研究_李哲伟.pdf

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