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Gaussian程序计算含碘、氢键、阴离子体系如何选择计算方法的问题?

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发布时间: 2024-5-8 22:10

正文摘要:

各位老师,同学你们好。以下是我计算的一个分子,准备使用的方法为M06-2X-D3/def2-TZVPP//B3LYP-D3(BJ)/def2TZVP,主要目的为优化结构以及能垒计算,想请教有没有不妥之处,是否有更好的选择。另外,由于体系中存在 ...

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emo舞者 发表于 Post on 2024-5-10 11:13:48
sobereva 发表于 2024-5-10 07:37
#里直接用def2SVP会自动对I加相应的赝势,自定义形式使用必须用genecp指定赝势
写法没错

好的非常感谢老师!
sobereva 发表于 Post on 2024-5-10 07:37:19
emo舞者 发表于 2024-5-9 11:18
老师您好,还有个小问题想要请教。就是优化时其他原子我用6-311G*,I用def2-SVP,这个时候用gen还是genec ...

#里直接用def2SVP会自动对I加相应的赝势,自定义形式使用必须用genecp指定赝势
写法没错
emo舞者 发表于 Post on 2024-5-9 11:20:02
Daniel_Arndt 发表于 2024-5-9 10:43
碘的话,隐式溶剂模型可能得注意,有时候得用之前在明尼苏达大学的Christopher J. Cramer的SMD18。

好的,感谢您的提醒。
emo舞者 发表于 Post on 2024-5-9 11:18:33
本帖最后由 emo舞者 于 2024-5-9 11:47 编辑
sobereva 发表于 2024-5-8 22:17
优化用6-311G*就够了,负电荷集中的原子用6-31+G*,I用def2-SVP或lanl08(d)

能垒计算时,负电荷集中的原 ...

老师您好,还有个小问题想要请教。就是优化时其他原子我用6-311G*,I用def2-SVP,这个时候用gen还是genecp?I还需要在最后定义赝势么(如下所示)?
# B3LYP/genecp opt freq em=GD3BJ

C H O 0
6-311G*
****
I 0
def2SVP
****

I 0
I-ECP     3     28
f potential
  4
2     19.45860900           -21.84204000
2     19.34926000           -28.46819100
2      4.82376700            -0.24371300
2      4.88431500            -0.32080400
s-f potential
  7
2     40.01583500            49.99429300
2     17.42974700           281.02531700
2      9.00548400            61.57332600
2     19.45860900            21.84204000
2     19.34926000            28.46819100
2      4.82376700             0.24371300
2      4.88431500             0.32080400
p-f potential
  8
2     15.35546600            67.44284100
2     14.97183300           134.88113700
2      8.96016400            14.67505100
2      8.25909600            29.37566600
2     19.45860900            21.84204000
2     19.34926000            28.46819100
2      4.82376700             0.24371300
2      4.88431500             0.32080400
d-f potential
  10
2     15.06890800            35.43952900
2     14.55532200            53.17605700
2      6.71864700             9.06719500
2      6.45639300            13.20693700
2      1.19177900             0.08933500
2      1.29115700             0.05238000
2     19.45860900            21.84204000
2     19.34926000            28.46819100
2      4.82376700             0.24371300
2      4.88431500             0.32080400
Daniel_Arndt 发表于 Post on 2024-5-9 10:43:56
碘的话,隐式溶剂模型可能得注意,有时候得用之前在明尼苏达大学的Christopher J. Cramer的SMD18。
emo舞者 发表于 Post on 2024-5-8 22:36:35
好的老师,非常感谢!
sobereva 发表于 Post on 2024-5-8 22:17:43
优化用6-311G*就够了,负电荷集中的原子用6-31+G*,I用def2-SVP或lanl08(d)

能垒计算时,负电荷集中的原子用ma-def2-TZVP

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