求助如何分析界面上水分子偶极子方位沿表面法线方向分布统计

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发布时间: 2024-5-9 09:32

请教一下各位大佬。我是用vasp模拟了一个动力学。现在我想分析界面上水分子偶极子方位沿表面法线方向分布统计，想做下面这样的图。有做过类似工作的大佬吗？能否提供一个脚本，或者有没有编程大佬能帮助我写一个后处 ...

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1030266769 发表于 Post on 2024-10-3 23:01:05

请问解决了嘛求一个脚本

yxzinc 发表于 Post on 2024-5-12 18:53:27

我就是专门做这一块的，据我所知，大家都是自己编写脚本算的，没有现成的
其实也不难，在z方向上分区域，统计每一块里水分子的个数和角度，角度是通过向量夹角的计算公式得到

sobereva 发表于 Post on 2024-5-10 23:25:20

可以借用gromacs自带的gmx h2order，要么自己写VMD tcl脚本

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