MuunYoo 发表于 2024-5-20 06:23 如果你已经做了结构优化,但是审稿人仍然提出这个问题,说明审稿人希望你做构象搜索。 注意多个苯环不能保证构象唯一 |
sobereva 发表于 2024-5-20 02:19 感谢sob大神的解答!我要计算的应该是我自己合成出来的多苯环的刚性分子,审稿人要求我计算其势能面以找到最低能量的构象,我正在为此想办法! |
dnlx 发表于 2024-5-19 22:28 我提交的初稿里只是优化了溶液情况下,我本来是用6-31g(d)+D3的。因为我文章的重点并不是计算,而是性质,本来包含的计算部分只是计算HOMO-LUMO,用变化趋势来简单解释实验结果,但是这个审稿人全都是针对我的计算部分进行提出意见……其中要补充大量的计算内容 |
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我不知道你算的什么分子。如果是柔性分子,必须做构象搜索,相当于寻找势能面(PES)上最低或者最低一批结构,看以下信息了解构象搜索常识 构型和构象搜索程序Molclus主页:http://www.keinsci.com/research/molclus.html 使用molclus程序做团簇构型搜索和分子构象搜索 http://bbs.keinsci.com/thread-577-1-1.html gentor:扫描方式做分子构象搜索的便捷工具 http://bbs.keinsci.com/thread-2388-1-1.html 将Confab或Frog2与Molclus联用对有机体系做构象搜索 http://bbs.keinsci.com/thread-20063-1-1.html 使用Molclus结合xtb做的动力学模拟对瑞德西韦(Remdesivir)做构象搜索 http://bbs.keinsci.com/thread-16255-1-1.html 柔性分子的NMR对构象往往很敏感,这是为什么必须考虑构象搜索问题。看下文对于氨基酸的NMR谱的绘制是怎么考虑的 使用Multiwfn绘制NMR谱 http://sobereva.com/565(http://bbs.keinsci.com/thread-19711-1-1.html) 看下文了解什么叫势能面(PES) 辨析计算化学中的任务类型和理论方法 http://sobereva.com/680(http://bbs.keinsci.com/thread-38982-1-1.html) 顺带强烈建议通过北京科音初级量子化学培训班(http://www.keinsci.com/workshop/KEQC_content.html)恶补下理论计算的各种基本知识,PES这种做计算最基本的概念都不知道的话,几乎不可能做正确、有意义的计算,每次审稿人一问就傻眼。 |
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就是让你气相和溶液相分别优化吧,你是不是只优化了气相情况?气相的势能面不能够代替溶液相的。 另外,6-311++G**基组是你投稿时就用的,还是审稿人要求你用的?NMR不需要加弥散: http://sobereva.com/119 |
Weldingspock 发表于 2024-5-19 16:09 感谢解答! |
| Potential energy surfaces势能面吧。 |
| 还有一点我不是很理解,为什么审稿人提出要看在气相和液相中结构呢(他具体是想看什么数据呢) |
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