在判断在判断HIS的质子化状态时，发现它与周围不形成氢键，它还要设置质子化吗？

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发布时间: 2024-5-19 19:26

如题，我在判断一个蛋白质在PH=7.4时，各氨基酸质子化状态时，发现有两个HIS需要判断其质子化状态，但是有一个HIS与周围都不形成氢键，是为什么呢？这种情况还需要设置质子化状态吗？

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Willow0114 发表于 Post on 2024-5-20 08:27:26

好的，感谢您的回复！

sobereva 发表于 Post on 2024-5-20 08:20:00

Willow0114 发表于 2024-5-20 08:00
感谢您的回复，Pka给我的是6.394，我需要根据氢键的位置判断HID还是HIE，但这个周围没有办法形成氢键，那怎 ...

那就无所谓了，质子化在哪都一样

Willow0114 发表于 Post on 2024-5-20 08:00:34

感谢您的回复，Pka给我的是6.394，我需要根据氢键的位置判断HID还是HIE，但这个周围没有办法形成氢键，那怎么判断它到底是哪种状态呢？

sobereva 发表于 Post on 2024-5-20 02:37:50

HIS够得到的地方没有氢键受体，自然就没法形成氢键
直接用pKa预测程序给你预测的结果

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