本帖最后由 艾小野 于 2024-5-23 22:02 编辑 我目前也是在用gmx_MMPBSA来分析蛋白质和配体之间的结合能分析，MD模拟中蛋白质是用的Amber14sb_parmbsc力场做的，小分子用的Sobtop的GAFF力场生成文件，在mpirun的时 ...
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