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分段计算共聚物的RESP电荷后如何合并

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发布时间: 2024-6-4 21:30

正文摘要:

效仿sob老师的博文《RESP拟合静电势电荷的原理以及在Multiwfn中的计算》(http://sobereva.com/441),将一个较大体系的共聚物进行拆分,并对连接端进行饱和后,用Multiwfn计算RESP电荷。现在我有几个片段的RESP电荷 ...

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sobereva 发表于 Post on 2024-6-8 19:39:39
nku_linz 发表于 2024-6-8 13:27
我想尝试一下拉直后做一个收敛阈值宽松的优化。平时产生ORCA输入文件都依赖于Multiwfn,设置收敛阈值的关 ...

我说的是几何优化收敛阈值,不是SCF收敛阈值
nku_linz 发表于 Post on 2024-6-8 13:27:49
sobereva 发表于 2024-6-8 00:06
可以尝试可以用描述色散作用不好的方法,比如B3LYP不加D3,也许能优化成比较延展的构象。拉直也可以,但 ...

我想尝试一下拉直后做一个收敛阈值宽松的优化。平时产生ORCA输入文件都依赖于Multiwfn,设置收敛阈值的关键词不太了解。参考了sloppy, tightSCF, verytightSCF对应的参数,将关键词更改如下是否合适?

! B97-3c opt noautostart miniprint nopop
%maxcore  2000
%pal nprocs   16 end
%SCF
TCut 1e-10
Thresh 1e-8
end
sobereva 发表于 Post on 2024-6-8 00:06:31
nku_linz 发表于 2024-6-7 22:57
谢谢社长解答!我尝试分段计算后,在MD时崩溃了,感觉是我分段不太合理导致RESP电荷不适用。
后来又想, ...

可以尝试可以用描述色散作用不好的方法,比如B3LYP不加D3,也许能优化成比较延展的构象。拉直也可以,但之后最好再优化一下,收敛阈值可以设得很宽松
nku_linz 发表于 Post on 2024-6-7 22:57:28
sobereva 发表于 2024-6-5 03:00
1 没有简单方法,除非体系特征很简单
2 Multiwfn算RESP电荷时恰当设置片段电荷的约束,保证重复单元区域净 ...

谢谢社长解答!我尝试分段计算后,在MD时崩溃了,感觉是我分段不太合理导致RESP电荷不适用。
后来又想,我的聚合物分子原子数是207,用ORCA里的B97-3c做优化和算单点似乎也能算的动,打算干脆一步到位。我先用了xtb里的GFN2优化,发现分子卷曲了,在ORCA里做完结构优化也是卷曲的构象。
1.我担心这样卷曲的构象分子内存在非共价作用,在算单点和之后的限制性计算RESP电荷会不会不合理?
2.可否参考您博文《利用Gaussian或ORCA程序把分子结构拉直的几种方法》http://bbs.keinsci.com/thread-22945-1-1.html 将两条聚合物链拉直,然后直接算单点用于计算RESP电荷?

sobereva 发表于 Post on 2024-6-5 03:00:52
1 没有简单方法,除非体系特征很简单
2 Multiwfn算RESP电荷时恰当设置片段电荷的约束,保证重复单元区域净电荷为期望值

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