求教如何处理界面张力值波动大问题

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发布时间: 2024-6-11 22:34

本帖最后由 zhangfaxue 于 2024-6-12 09:34 编辑油水界面，x是最长的，界面垂直于x轴，NPT系综跑了50ns利用公式计算界面张力，有如下几个问题：首先我的mdp文件如下：问题： 1、求助含表面活性剂的油 ...

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zhangfaxue 发表于 Post on 2024-6-12 22:21:04

sobereva 发表于 2024-6-12 16:12
1 数值越小，采样越多、统计精度越高。速度的影响实测便知。不是很小的值不至于对性能有多大影响

2 旋转 ...

谢谢老师！

sobereva 发表于 Post on 2024-6-12 16:12:32

1 数值越小，采样越多、统计精度越高。速度的影响实测便知。不是很小的值不至于对性能有多大影响

2 旋转体系再模拟。应尽量保持和习俗一致，即界面平行于XY，否则很多分析工具/脚本都没法直接用

3 只有对已平衡的区段进行统计才有实际意义

zhangfaxue 发表于 Post on 2024-6-12 09:35:06

sobereva 发表于 2024-6-12 04:48
引用北京科音分子动力学与GROMACS培训班（http://www.keinsci.com/workshop/KGMX_content.html）里的ppt时 ...

谢谢老师提醒，我已重新修改

sobereva 发表于 Post on 2024-6-12 04:48:26

引用北京科音分子动力学与GROMACS培训班（http://www.keinsci.com/workshop/KGMX_content.html）里的ppt时不得把顶端的版权信息截掉
已经把你的图删了，以后注意

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