向金属进行加成的反应，柔性扫描结果没有最高点，请问这是怎么回事呢？

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发布时间: 2024-6-14 10:57

各位老师好，我做了一个过渡金属催化过程中，向金属进行加成反应的过渡态搜索。先是对体系进行了限制性优化，确定了有这个过渡态存在，但是进行过渡态搜索时，一直没找到对应的伸缩振动的过渡态。现在是对整个体系进 ...

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candicechen 发表于 Post on 2024-6-17 10:52:44

Freeman 发表于 2024-6-15 22:17
限制性优化收敛了且有一个虚频，并不代表找到了过渡态。有虚频只说明能量沿着虚频方向二阶导数是负的，或者 ...

嗯嗯，我明白了，谢谢老师！

Freeman 发表于 Post on 2024-6-15 22:17:37

限制性优化收敛了且有一个虚频，并不代表找到了过渡态。有虚频只说明能量沿着虚频方向二阶导数是负的，或者说势能面沿着虚频方向是向上凸的，既可能是过渡态，也可能是像个山脊一样的结构。你限制键长在1.8优化，有一个虚频，对应的正好是你给的扫描能量图1.8位置周围的上凸部分，并不是过渡态。

sai77 发表于 Post on 2024-6-15 10:26:35

candicechen 发表于 2024-6-14 17:18
老师，不好意思，再问一下，我的最开始的B-H键的键长是1.2，加成后优化的产物的B-H键长是1.3，但是做限制 ...

加成的B-H键长不太正常，只变长这么一点
试试看吧

candicechen 发表于 Post on 2024-6-14 17:18:53

sai77 发表于 2024-6-14 11:55
扫描的初始结构不太合理，B离金属中心太近了
可以先把氧化加成的产物结构优化出来，再扫描B-H键距离缩短

老师，不好意思，再问一下，我的最开始的B-H键的键长是1.2，加成后优化的产物的B-H键长是1.3，但是做限制性优化得到的最负频对应的结构的B-H键长是1.8，那我现在用氧化加成产物做柔性扫描，设置成 B H S 10 -0.01，是合理的吗？

candicechen 发表于 Post on 2024-6-14 16:19:22

sai77 发表于 2024-6-14 11:55
扫描的初始结构不太合理，B离金属中心太近了
可以先把氧化加成的产物结构优化出来，再扫描B-H键距离缩短

嗯嗯，这是反向扫描的意思吗？我优化出来的结构的B和金属的距离也挺近的

sai77 发表于 Post on 2024-6-14 11:55:35

扫描的初始结构不太合理，B离金属中心太近了
可以先把氧化加成的产物结构优化出来，再扫描B-H键距离缩短

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