gmx跑MD模拟小体系分子N2H4被拆开

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发布时间: 2024-6-14 20:40

打扰各位老师，请教个问题，如图跑N2H4肼纯相盒子，pdb文件NH2-NH2是有键相连的，跑完md后就全断了，变成了NH2了，请问老师这种情况有什么建议，不让分子散掉么？请老师指点下，麻烦各位老师，谢谢

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sobereva 发表于 Post on 2024-6-15 00:35:05

N-N的bond项大概率不合理，力常数太小，或者这项完全缺失了

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