求助：如何在AIMD NVT系综对单原子催化剂稳定性测试得到M-N键长结果

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发布时间: 2024-6-17 17:25

本帖最后由 VicX 于 2024-6-17 17:27 编辑各位老师好，我想请教关于AIMD的几个问题。之前借助B站上up主提供的INCAR、ICONST文件对我的Ni-N4模型的进行标准的从头算分子动力学模拟，充分平衡界面（10ps）；而后 ...

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VicX 发表于 Post on 2024-6-29 10:21:09

针灸大师容嬷嬷发表于 2024-6-19 10:48
键长的变化，可以把轨迹文件导入到vmd中，然后选择对应的原子，就可以了。置于预平衡，我没把握，但是我个 ...

你好，我第一次使用VMD软件，请问如何选择对应原子呢？在b站上找没有找到，可以麻烦请教一下吗

针灸大师容嬷嬷 发表于 Post on 2024-6-19 10:48:13

键长的变化，可以把轨迹文件导入到vmd中，然后选择对应的原子，就可以了。置于预平衡，我没把握，但是我个人觉得是有必要加的。

VicX 发表于 Post on 2024-6-18 08:47:12

冒昧顶一下

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