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过渡金属蛋白动力学模拟应使用约束模型还是成键模型

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发布时间: 2024-6-18 15:54

正文摘要:

各位老师好,我最近在进行过渡金属-蛋白复合物的分子动力学模拟。如果模拟过程单纯靠静电和范德华维持的话过渡金属离子不能稳定地与配位原子结合,可以通过施加约束、限制或者构建成键模型来实现模拟过程中过渡金属 ...

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sobereva 发表于 Post on 2024-6-18 19:12:36
如果当前目的仅仅是能维持住局部区域的结构,而这部分区域与其它原子的静电相互作用不是什么重点,细腻地考虑电荷转移就没必要

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