怎么使用packmol把分子插入指定的位置

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发布时间: 2024-6-19 16:02

请教一下各位老师，如下图，我应该怎么使用packmol把水分子插入图中红线标注那一层，并使之填满，其余的地方皆没有水分子

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dayu8278 发表于 Post on 2024-6-20 09:56:33

zhangs 发表于 2024-6-20 09:33
您好，我看您的帖子是去除，而我的是加入水分子

不是一回事么，你先用gmx solvate加水，然后去掉多余的水分子不就可以了？

zhangs 发表于 Post on 2024-6-20 09:33:55

dayu8278 发表于 2024-6-19 22:02
用vmd就可以。

我昨天发的帖子还问这个问题呢。

您好，我看您的帖子是去除，而我的是加入水分子

sobereva 发表于 Post on 2024-6-19 22:16:58

dayu8278 发表于 Post on 2024-6-19 22:02:44

用vmd就可以。

我昨天发的帖子还问这个问题呢。

http://bbs.keinsci.com/thread-46467-1-1.html

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