sobereva 发表于 2024-6-19 22:02
参考北京科音分子动力学与GROMACS培训班（http://www.keinsci.com/workshop/KGMX_content.html）的ppt。并 ...

可是sob老师，我已经按照力场里的名称将CD改为CD2，还是提示找不到，是因为格式的问题吗（比如说中间少了一个空格之类的）？

参考北京科音分子动力学与GROMACS培训班（http://www.keinsci.com/workshop/KGMX_content.html）的ppt。并且注意改pdb文件的时候必须满足格式要求，第几列到第几列对应原子名必须搞清楚，强烈建议在文本编辑器里用等宽字体。