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求助:在进行构型搜索后,出现断键的情况怎么解决

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发布时间: 2024-6-20 09:06

正文摘要:

硫酸和水进行构型搜索,之后出现这种情况

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sobereva 发表于 Post on 2024-6-21 06:11:01
老生常谈的问题
谈谈原子间是否成键的判断问题
http://sobereva.com/414http://bbs.keinsci.com/thread-9840-1-1.html
乐平 发表于 Post on 2024-6-20 14:19:18
图形显示软件(GaussView,或者 VMD 等等)显示的都不是真实的 “化学键”,只不过是连接方式而已。不要把看到的连线当化学键,也不要没看到连线就认为没有化学键。

说得更极端一些,化学键本来就不是实实在在的物质。世界上根本就没有化学键,只不过是化学家为了形象解释原子之间的关联定义出来的概念而已。本质上是原子间的距离。在某个距离范围内,某些原子的相互作用很强,好像被绑在一起,就是所谓的“化学键”。

图形显示软件(GaussView,或者 VMD 等等)也是类似地原理,如果某两个原子在某个范围内,就显示它们成键,否则就不显示连线。如果在更短的距离,就显示成“双键”,如果比双键的距离更短,就显示成“三键”。仅此而已。所以,只是显示而已,并不是真正的化学键。

所以,不要看连线,也不要在意那些短线。更应该关注原子间的距离。

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