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VASP结构收敛正常结束但是力不收敛问题请教

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发布时间: 2024-6-27 21:51

正文摘要:

本帖最后由 KCM@SHU 于 2024-6-27 21:57 编辑 各位老师好,我最近接触到VASP,我想问一下各位老师在VASP结构收敛的时候程序显示达到设定收敛值,但是在检查力的收敛的时候发现没有达到设定值,我设定的是EDIFFG = ...

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乐平 发表于 Post on 2024-6-29 22:11:28
KCM@SHU 发表于 2024-6-29 22:09
老师我看了,我在网上搜的一些教程里面说不太熟练的情况下不要动KPAR,主要改变NCORE,然后我就先改变了N ...

网上的所谓教程要么太古老,要么害死人……
KCM@SHU 发表于 Post on 2024-6-29 22:09:47
乐平 发表于 2024-6-29 22:01
你真的仔细看了我的贴子吗?

你设置了 KPAR 和 NCOER 两个参数配合了吗?

老师我看了,我在网上搜的一些教程里面说不太熟练的情况下不要动KPAR,主要改变NCORE,然后我就先改变了NCORE,但是运行的时候我看他和我没设NCORE的时候出现的warning一样,我以为是我的NCORE命令没被识别所以问一下您,KPOINTS我已经修改了,VASP已经可以读取了,计算量大了很多,所以我最近在看NCORE的使用方法,我先看一下您推荐的视频讲解,谢谢老师
乐平 发表于 Post on 2024-6-29 22:01:34
KCM@SHU 发表于 2024-6-29 21:58
好的老师我看看,那他个这个关于NCORE的warning是不管怎么设置都会出现嘛?,我理解的是这个warning是提 ...

你真的仔细看了我的贴子吗?

你设置了 KPAR 和 NCOER 两个参数配合了吗?

另外,之前指出了你的 KPOINT 是错的,应该是 KPOINTS ,你改名字了吗?
KCM@SHU 发表于 Post on 2024-6-29 21:58:33
乐平 发表于 2024-6-29 21:45
KPAR, NCORE  当然是在 INCAR 里啊

仔细看我上面的帖子,对你的计算速度提升很有帮助

好的老师我看看,那他个这个关于NCORE的warning是不管怎么设置都会出现嘛?,我理解的是这个warning是提醒我NCORE=1计算效果很慢,但是我在INCAR里面设置了INCAR=16了
乐平 发表于 Post on 2024-6-29 21:45:58
本帖最后由 乐平 于 2024-6-29 22:04 编辑
KCM@SHU 发表于 2024-6-29 21:36
老师我是想问一下NCORE是直接写进INCORE里面就可以修改计算方式还是要在其他文件里面修改呢?

KPAR, NCORE  当然是在 INCAR 里啊
看来你对 VASP 各个输入文件的基本内容不熟悉,建议先看看下面的视频
VASP输入文件
https://www.bilibili.com/video/B ... 828517ca6bef0a8956b



另外,仔细看我上面的帖子,对你的计算速度提升很有帮助

最后,建议用 VASPKIT 来准备你的输入文件 INCAR, POTCAR, KPOINTS
下面是VASPKIT软件开发者王伟老师介绍 VASPKIT 使用的视频(从安装到使用都有详细介绍)
https://www.bilibili.com/video/B ... 828517ca6bef0a8956b


KCM@SHU 发表于 Post on 2024-6-29 21:36:25
乐平 发表于 2024-6-29 21:24
关于并行效率,看我之前的帖子

http://bbs.keinsci.com/forum.php?mod=redirect&goto=findpost&ptid=3 ...

老师我是想问一下NCORE是直接写进INCORE里面就可以修改计算方式还是要在其他文件里面修改呢?
KCM@SHU 发表于 Post on 2024-6-29 21:25:04
卡开发发 发表于 2024-6-28 11:54
我自己写了一小段代码,看了一下你最后一步的力是7e-3左右,下面的代码我没有考虑原子固定的情况,实际上要 ...

谢谢老师分享
乐平 发表于 Post on 2024-6-29 21:24:18
KCM@SHU 发表于 2024-6-29 21:22
好的,谢谢老师,老师我还想问一下NCORE这个命令是可以直接加到INCAR里面的吗?我再INCAR里面写上NCORE=1 ...

关于并行效率,看我之前的帖子

http://bbs.keinsci.com/forum.php ... 87&fromuid=1532
乐平 发表于 Post on 2024-6-28 17:10:05
卡开发发 发表于 2024-6-28 11:54
我自己写了一小段代码,看了一下你最后一步的力是7e-3左右,下面的代码我没有考虑原子固定的情况,实际上要 ...

卡老师读取表格的代码很优雅,值得学习

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参与人数
Participants 1
eV +1 收起 理由
Reason
卡开发发 + 1 没有,大家互相学习。

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乐平 发表于 Post on 2024-6-28 17:08:51
KCM@SHU 发表于 2024-6-27 22:36
好的老师,我看一下,我最近刚接触VASP,赝势我当时选的时候就看文件后面带个NEW我就想着最新的就选了, ...

抱歉,是我的代码里有个地方写错了,现在更新了

  1. np.amax(np.linalg.norm(data, axis=-1), axis=-1)
复制代码

之前的轴弄错了,应该是 -1 轴

http://bbs.keinsci.com/forum.php ... 293265&fromuid=1532
卡开发发 发表于 Post on 2024-6-28 11:54:23
KCM@SHU 发表于 2024-6-27 22:36
好的老师,我看一下,我最近刚接触VASP,赝势我当时选的时候就看文件后面带个NEW我就想着最新的就选了, ...
我自己写了一小段代码,看了一下你最后一步的力是7e-3左右,下面的代码我没有考虑原子固定的情况,实际上要处理固定也不麻烦,欢迎坛友有兴趣自己来扩展。
  1. import sys
  2. import re
  3. from io import StringIO
  4. import numpy as np

  5. """
  6. 使用方法:python3 get_max_forces.py OUTCAR
  7. """


  8. class VaspData(object):
  9.     def __init__(self, outcar) -> None:
  10.         self.outcar = outcar

  11.     @property
  12.     def max_forces(self):
  13.         pattern = '(.*?)'.join(['TOTAL-FORCE \(eV/Angst\)\n ?-+\n',
  14.                                 '-+\n +total drift'])
  15.         string = re.findall(pattern, self.outcar, re.S)
  16.         forces = [np.loadtxt(StringIO(s)).reshape(-1, 6)[:, 3:]
  17.                   for s in string]
  18.         max_forces = [np.max(np.linalg.norm(f, axis=1)) for f in forces]
  19.         return max_forces


  20. if __name__ == '__main__':
  21.     with open(sys.argv[1]) as f:
  22.         outcar = f.read()
  23.         outputs = VaspData(outcar)
  24.         for i, fmax in enumerate(outputs.max_forces):
  25.             print('%5d %.3e' % (i, fmax))
复制代码



KCM@SHU 发表于 Post on 2024-6-27 22:36:25
乐平 发表于 2024-6-27 22:14
也没差太多……

另外,由于你的 KPOINTS 文件名没有S (你的是 KPOINT),于是,你的 OUTCAR 里 645  ...

好的老师,我看一下,我最近刚接触VASP,赝势我当时选的时候就看文件后面带个NEW我就想着最新的就选了,我试试改一下KPOINTS和换个赝势试试,我把计算精度也提高一下试试看看能不能达到收敛标准,谢谢老师
乐平 发表于 Post on 2024-6-27 22:14:55
本帖最后由 乐平 于 2024-6-27 22:24 编辑
KCM@SHU 发表于 2024-6-27 22:03
老师我是按照您之前的那个代码绘制的图判断的,我看图里面最后一步受力明显大于0.01,刚刚图片没上传上去 ...

也没差太多……

另外,由于你的 KPOINTS 文件名没有S (你的是 KPOINT),于是,你的 OUTCAR 里 645 行警告说没找到 KPOINTS 文件,于是自动产生了 1 1 1 k-点


还有,你的赝势为什么都选的是  _GW 结尾的啊…… 你又不是算光学性质

Available pseudopotentials - VASP Wiki
GW potentials are recommended for calculations involving unoccupied states, e.g., computing optical properties or using many-body perturbation theory.

当然,这可能不是力没收敛的原因


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