请教下大家，有关于的MD平衡模拟和PMF计算自由能的先后顺序：对于平衡MD而言，我在一个充满水的边长为5nm的盒子中添加了5个环糊精和5个哌嗪分子（使用gaff力场参数结合resp2(0.5)电荷，spc/e三点水），1bar和298K下 ...
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