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转换fch文件出现报错

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发布时间: 2024-7-3 08:35

正文摘要:

各位老师好,我计算一个体系的激发态,输出文件正常结束,chk文件输出有70.18G,转换fch文件出现内存错误,论坛中谈到的方法 export GAUSS_MEMDEF=2000000000 已经试过,与超算工程师交流说是文件问题,已重复计算三 ...

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乐平 发表于 Post on 2024-7-3 23:34:19
sobereva 发表于 2024-7-3 19:43
%mem是gjf里的,不能写在命令行里
指定formchk的内存最多使用量要么用GAUSS_MEMDEF环境变量,要么加上-m ...

谢谢 Sob 老师指导
sobereva 发表于 Post on 2024-7-3 19:43:09
乐平 发表于 2024-7-3 11:22
请教 Sob 老师
运行 formchk 命令也可以指定内存使用量吗?

%mem是gjf里的,不能写在命令行里
指定formchk的内存最多使用量要么用GAUSS_MEMDEF环境变量,要么加上-m(G16 C.01及之后支持),例如formchk -m=1GB foo.chk
乐平 发表于 Post on 2024-7-3 11:22:19
sobereva 发表于 2024-7-3 08:53
GAUSS_MEMDEF=2000000000根本不够,这才相当于1907MB,提示写明了要4911MW,折合39288MB。根本不是文件的问 ...

请教 Sob 老师
运行 formchk 命令也可以指定内存使用量吗?

如果写在 formchk 前面,会报错
  1. # %mem=100GB formchk h2o.chk
  2. -bash: fg: %mem=100GB: no such job
复制代码


如果写在 formchk 结尾,不知道是否调用了更多的内存
  1. # formchk h2o.chk %mem=100GB
  2. Read checkpoint file h2o.chk type G16
  3. Write formatted file %mem=100GB.fchk
  4. FChkPn:  Coordinates translated and rotated.
  5. FChkPn:  Coordinates match /B/ after translation and rotation.
复制代码
学习ing 发表于 Post on 2024-7-3 08:59:03
sobereva 发表于 2024-7-3 08:53
GAUSS_MEMDEF=2000000000根本不够,这才相当于1907MB,提示写明了要4911MW,折合39288MB。根本不是文件的问 ...

好的,谢谢老师,我再与工作人员交流一下
sobereva 发表于 Post on 2024-7-3 08:53:04
GAUSS_MEMDEF=2000000000根本不够,这才相当于1907MB,提示写明了要4911MW,折合39288MB。根本不是文件的问题

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