没办法，这个方法连调整颜色的接口都没，要改源代码。可以这样做，需要找到ase.gui所在的位置，先要在命令行下进入python环境：

1. [命令行]$ python
   
2. [Python]>>> from ase import gui
   
3. [Python]>>> gui.__file__

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这样可以找到ase.gui所在的目录，然后在该目录下找到ui.py，更改如下部分：

1. ase.gui目录下ui.py:
   
2. class ASEGUIWindow(MainWindow):
   
3.     def __init__(...
   
4.         ....
   
5.      def line(self, bbox, width=1):
   
6.         self.canvas.create_line(*tuple(int(x) for x in bbox), width=width)

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将create_line这里的增设颜色填充选项fill='black'，如：

1.     self.canvas.create_line(*tuple(int(x) for x in bbox), width=width, fill='black')

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这样试试，如果还不行可以换个别的颜色，如red或者blue。

比较彻底一点的做法是在line这里也传参color，然后让fill=color，然后到菜单上的颜色去增设这个选项，不过要对gui的模块和tkinter比较熟悉，哪位活雷锋愿意做可以试试看。