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CP2K用RIMP2来算碳管和水的相互作用能输入文件参数设置问题

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发布时间: 2024-7-5 16:06

正文摘要:

各位大佬好,我想要用RIMP2来算碳管和水的相互作用能,但是跑CP2K计算的时候出现一些小问题,想了很久找不出解决办法,不知道是不是我的参数设置的不合理,跑大体系跑不了,所以发帖向各位大佬求助,万分感谢。(附 ...

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sobereva 发表于 Post on 2024-7-8 12:45:33
18528305743 发表于 2024-7-8 12:26
好的,谢谢老师指点,我想做的是用RIMP2试着算一下碳和水的相互作用,模拟的是周期性体系,那个c写错了, ...

这个属于非常具体、专一的问题,培训里不可能恰好有这么个例子。但培训里讲的内容和示例,足矣令你能够举一反三正确合理计算当前这个问题。
18528305743 发表于 Post on 2024-7-8 12:26:47
Stardust0831 发表于 2024-7-6 09:39
RI-MP2标度为O(N5),本身就远比纯泛函其昂贵,是不适合结构优化这种较贵的任务的。可以用PBE-D3做结构优化 ...

好的,谢谢老师指点,我想做的是用RIMP2试着算一下碳和水的相互作用,模拟的是周期性体系,那个c写错了,不是20。老师请问有培训班这个浸在水里的碳纳米管模拟的讲解吗?我还是新手想着学一下
18528305743 发表于 Post on 2024-7-8 12:22:44
sobereva 发表于 2024-7-7 17:35
一个孤立碳纳米管片段,边缘必须用氢饱和,哪能像这么悬着。
当前各种瞎设,一个孤立体系优化算什么应力张 ...

抱歉老师,我输入文件写错了,我想写的是周期性体系,c那里应该不是20,感谢老师批评指正
sobereva 发表于 Post on 2024-7-7 17:35:47
一个孤立碳纳米管片段,边缘必须用氢饱和,哪能像这么悬着。
当前各种瞎设,一个孤立体系优化算什么应力张量。MP2优化这种体系又巨慢又没任何额外的好处。SCREEN_ON_INITIAL_P TRUE居然还不读合理的波函数当初猜,缺乏HF/杂化泛函计算的最基本常识,而且一个孤立体系设什么库仑截断CUTOFF_RADIUS 4.9,完全莫名其妙。仔细看《CP2K做杂化泛函计算的关键要点和简单例子》http://sobereva.com/690了解点基本常识。这么个孤立体系的计算,而且还是要算相互作用能,用PSOLVER wavelet当非周期性计算比你用PERIODIC当三维周期性计算好得多。对于一个严重不合理的结构而且是没有意义的计算,问报错怎么解决毫无意义。

你对CP2K的使用知识了解得一塌糊涂。前面有人说了,拿量化程序算这个是更好的选择,如果非要用CP2K的话,强烈建议通过北京科音CP2K第一性原理计算培训班(http://www.keinsci.com/workshop/KFP_content.html)好好系统性学学,否则不可能得到有意义的结果。
18528305743 发表于 Post on 2024-7-6 19:08:38
吞木木 发表于 2024-7-5 17:01
https://groups.google.com/g/cp2k/c/V6wsxjR39Fs/m/taL6CO3aBQAJ
https://groups.google.com/g/cp2k/c/HB ...

感谢大佬的回复,这是他的输出文件,请大佬查看一下。

RI_cw1.zip

235.29 KB, 下载次数 Times of downloads: 1

Stardust0831 发表于 Post on 2024-7-6 09:39:51
RI-MP2标度为O(N5),本身就远比纯泛函其昂贵,是不适合结构优化这种较贵的任务的。可以用PBE-D3做结构优化,然后在纯泛函级别下计算一次能量,让RI-MP2读取纯泛函级别计算得到的波函数当初猜再算能量。另外,你输入文件里真空层很大,猜测你可能是想当孤立体系计算,计算孤立体系的话用高斯或者ORCA这样的量子化学计算软件可能更能满足你需要。另外,社长的gmx培训班里也专门讲过浸在水里的碳纳米管的模拟,考察了水在碳纳米管附近的分布、也可以提取出碳纳米管和水的相互作用能。
吞木木 发表于 Post on 2024-7-5 17:01:02

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