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请教dmol3计算表面吸附物种吸附自由能时自由能矫正的计算方法

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发布时间: 2024-7-5 17:17

正文摘要:

         老师们好最近需要使用dmol3算一个表面吸附的体系,在下之前常用的是VASP,对dmol3不是很熟悉,想请教下使用dmol3计算频率做自由能矫正的方法相关的问题。 1,是否其它设置 ...

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卡开发发 发表于 Post on 2024-7-5 22:16:10
1、如果你要计算的是部分频率,那就需要把需要参与频率计算(也就是实施有限位移)的原子进行你描述的操作,同时还要在勾选frequency的基础上勾选Calculate partial Hessian。
2、计算量是6*N,这里的N指的是你选中为HessianAtoms的原子数。
3、Partial Hessian的计算实际上是给过渡态精修TS opt来用的,所以这种情况给不出热化学数据,如果非要用Partial Hessian去处理热化学数据,可以将计算得到的频率导出用ase进行后处理或者自己用excel算。
4、如无意外不推荐勾选Use coarse-grained parallel,否则程序会将用于力差分而产生有限位移的结构在不同的核上平行跑,但对于DMol3这种做法效率不是很高。

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白皛白 + 5 非常感谢发发老师的答疑

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