常温下PMF图中主客体结合过程中能垒是否可以越过

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发布时间: 2024-7-6 23:12

本帖最后由 JCenter 于 2024-7-6 23:13 编辑请教下大家，我基于gmx程序，通过伞状采样（NPT,298K，1bar，GAFF力场，RESP2(0.5)电荷，SPC/E三点水）计算了有机客体从主体环中拉出的PMF，如图所示。通过PMF,我发现 ...

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JCenter 发表于 Post on 2024-7-8 09:02:33

sobereva 发表于 2024-7-7 16:27
能。但前提是客体本身容易稳定结合在端口，从而能够有频繁的碰撞

好嘞，谢谢老师

sobereva 发表于 Post on 2024-7-7 16:27:07

能。但前提是客体本身容易稳定结合在端口，从而能够有频繁的碰撞

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