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VMD选择一定区域内逐帧原子个数脚本输出总为整个体系总原子数,如何解决。

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cgy
发布时间: 2024-7-7 11:45

正文摘要:

本帖最后由 cgy 于 2024-7-7 11:48 编辑 各位老师好,本人新手,在使用VMD进行可视化分析时,想要求x>0 and x<50 and y>0 and y<50 and z>130 and z<150区域的逐帧原子数,学习一段时间VMD脚本语言后 ...

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cgy 发表于 Post on 2024-7-8 10:18:38
丁越 发表于 2024-7-8 09:26
animate goto $i
改为:
$sel frame $i

set sel [atomselect top "water and x > 0 and x < 50 and y > 0 and y < 50 and z > 130 and z < 150"]
for {set i 0} {$i <= 201} {incr i} {
    $sel frame $i
    $sel update
puts "Frame $i: [expr [$sel num]]"
}
您好,经过您的指导,和http://bbs.keinsci.com/forum.php ... A%D0%C4%BE%E0%C0%EB这一篇的输出结果的语句参考,已经解决问题,最终输出了该区域的逐帧分子数,再次感谢您!

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ptj + 3 谢谢

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丁越 发表于 Post on 2024-7-8 09:26:24
animate goto $i
改为:
$sel frame $i
$sel update
把set sel [atomselect top "x > 0 and x < 50 and y > 0 and y < 50 and z > 130 and z < 150"]挪到for循环外面去

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cgy + 4 我很赞同

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