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关于dalton双光子吸收截面与双光子吸收波长的关系图要如何绘制

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发布时间: 2024-7-8 15:09

正文摘要:

各位老师好,我在使用dalton的时候,已经可以成功计算出分子结构的双光子最大吸收截面以及对应的吸收波长,但是我想请教一下各位老师要如何绘制像文献一样的双光子吸收截面与吸收波长之间的关系,即双光子吸收光谱图 ...

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Yaoyl 发表于 Post on 2024-12-11 20:57:13

老师,我根据您分享的内容,查看了muitiwfn手册的对应部分,里面有关于激发能、振子强度和摩尔吸收吸收系数的公式,里面我有两个问题,一个是反推的话,公式是加权求和并且高斯函数及其中的参数未知,第二个问题是我是通过利用激发能和双光子吸收截面在multiwfn中展宽得到光谱图,利用代入公式的是不是也是反推出激发能和双光子吸收截面?这个双光子吸收系数的反推还是不太清楚,能不能再辛苦老师指导一下
cokie 发表于 Post on 2024-12-11 12:03:28
Yaoyl 发表于 2024-12-11 10:20
谢谢老师,老师我还想问一下我这边在multiwfn中利用高斯展宽得到了光谱图,因为高斯函数里面没摩尔吸收系 ...

参看multiwfn手册

multiwfn_mannul_p262.png (234.64 KB, 下载次数 Times of downloads: 55)

multiwfn_mannul_p262.png
Yaoyl 发表于 Post on 2024-12-11 10:20:00
cokie 发表于 2024-12-10 22:16
sob老师multiwfn绘制uv-vis光谱时得到的摩尔消光系数,是根据激发能+对应振子强度根据高斯展宽得到的。具 ...

谢谢老师,老师我还想问一下我这边在multiwfn中利用高斯展宽得到了光谱图,因为高斯函数里面没摩尔吸收系数,如何按照您说的利用现有的数据进行逆推啊?

高斯函数.png (36.76 KB, 下载次数 Times of downloads: 53)

高斯函数.png

spectrum_curve.txt

93.75 KB, 下载次数 Times of downloads: 3

spectrum_line.txt

2.26 KB, 下载次数 Times of downloads: 3

cokie 发表于 Post on 2024-12-10 22:16:28
Yaoyl 发表于 2024-12-10 21:13
老师,您好,我想问一下怎么利用摩尔吸收系数转换成双光子吸收系数啊?这边有两张图片,以摩尔吸收系数为 ...

sob老师multiwfn绘制uv-vis光谱时得到的摩尔消光系数,是根据激发能+对应振子强度根据高斯展宽得到的。具体公式可以搜multiwfn手册里的关键词“Theory of CTS”。

你在用multiwfn绘制双光子吸收系数/吸收界面曲线时所用的.txt文件,实际上就是把绘制紫外时,所需要的激发能和对应的振子强度,换成了吸收系数和对应的吸收截面罢了。所以按uv-vis绘制出来光谱所得到的消光系数,实际上就是通过“吸收系数+对应吸收截面”进行高斯展宽得到的,所以根据公式逆推回去,自然就能把纵坐标推回相应的双光子吸收系数。
Yaoyl 发表于 Post on 2024-12-10 21:13:34
cokie 发表于 2024-7-10 16:03
半峰宽(FWHM)设窄一点就行。
我把你的log改了一下,定好了具体的半峰宽,直接加载,然后改一下横坐标 ...

老师,您好,我想问一下怎么利用摩尔吸收系数转换成双光子吸收系数啊?这边有两张图片,以摩尔吸收系数为纵坐标的是我根据dalton计算的out文件,提取数据写成txt格式,然后利用Mulitwfn处理出来的吸收光谱图,另一张是典型的双光子吸收系数光谱图,您看一下是我哪个地方不太对?下面附了相应的数据文件。

dislin.png (36.23 KB, 下载次数 Times of downloads: 46)

dislin.png

双光子.jpg (433.67 KB, 下载次数 Times of downloads: 59)

双光子.jpg

ta2.out

252.43 KB, 下载次数 Times of downloads: 4

ta2.txt

342 Bytes, 下载次数 Times of downloads: 2

Yaoyl 发表于 Post on 2024-12-10 11:20:13
您好,我想问一下您通过Multiwfn软件做出双光子光谱图后,它的纵坐标是摩尔吸收系数,怎么转换成双光子吸收系数啊?
cokie 发表于 Post on 2024-7-10 16:03:46
本帖最后由 cokie 于 2024-7-10 16:05 编辑
zhouyulin 发表于 2024-7-10 15:05
老师,我昨天尝试了一下我得到的光谱,与文献数据还是差许多,是我自己的输入文件设置的有问题,还是图还 ...

半峰宽(FWHM)设窄一点就行。
我把你的log改了一下,定好了具体的半峰宽,直接加载,然后改一下横坐标范围就行了。另外其余9行数据既然没有数值,删了也可以。

EG.png (128.45 KB, 下载次数 Times of downloads: 76)

EG.png

test-new.log

47 Bytes, 下载次数 Times of downloads: 12

zhouyulin 发表于 Post on 2024-7-9 13:46:23
cokie 发表于 2024-7-9 09:42
你就用Multiwfn按紫外光谱的逻辑来绘制就行:

双光子吸收波长跟紫外吸收波长对应,都是第一列的内容( ...

我知道了,我再去试试,谢谢老师
cokie 发表于 Post on 2024-7-9 09:42:43
本帖最后由 cokie 于 2024-7-9 09:47 编辑
zhouyulin 发表于 2024-7-8 23:58
但是老师我想几个问题问一下
(1)绘制光谱的输入文件对应的横纵坐标的怎么办,我这边的纵坐标和横坐标 ...

你就用Multiwfn按紫外光谱的逻辑来绘制就行:

双光子吸收波长跟紫外吸收波长对应,都是第一列的内容(填以eV为单位的能量,但eV不需要写);
纵坐标双光子吸收截面你就当振子强度填就行(把第二列填成双光子吸收截面的数值)
第三列的8.0是半峰宽的意思,根据你的实际需求设置(不过设置多少无所谓,你用Multiwfn载入之后,在选项8“ Input full width at half maximum (FWHM), current:   0.80000 eV”里还是可以改的)

按上述填好,用multiwfn按紫外波长读取,你就可以得到紫外的图,这时候横坐标是波长,纵坐标虽然你写的是双光子吸收截面,但是Multiwfn显示的Y轴是振子强度(数值是你自己填的双光子吸收截面的数值),这无所谓,你只需要选择2号选项“ Export X-Y data set of lines and curves to plain text file”,输出curve,自己在origin里作图,然后把纵坐标改成双光子吸收截面即可。
sobereva 发表于 Post on 2024-7-8 23:10:52
试图自行整理成Multiwfn绘制光谱通用的文本格式作为输入文件,在Multiwfn手册这一节说了

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