计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register

对xpm文件进行可视化,除了使用xpm2ps命令,还有没有别的方法?

查看数: 3065 | 评论数: 10 | 收藏 Add to favorites 0
关灯 | 提示:支持键盘翻页<-左 右->
    组图打开中,请稍候......
发布时间: 2024-7-10 12:42

正文摘要:

各位老师好,我用sham命令生成了gibbs.xpm文件,在后续使用xpm2ps命令获得eps文件后,感觉图片不是很美观,想问一下还有没有别的什么方法可以得到比较美观的图片

回复 Reply

12313 发表于 Post on 2024-7-12 17:43:27
dayu8278 发表于 2024-7-12 09:37
不应该直接运行sh就可以了吗,为啥后面要跟着xpm呢

xpm是我的输入文件,而且我只输入sh plot.sh也得到了同样的报错
dayu8278 发表于 Post on 2024-7-12 09:37:37
12313 发表于 2024-7-12 09:23
老师,我在linux系统下用sh试了一下,但是出错了,不知道是不是我输得命令有错啊

不应该直接运行sh就可以了吗,为啥后面要跟着xpm呢
dayu8278 发表于 Post on 2024-7-11 19:37:33
12313 发表于 2024-7-11 10:06
我保存成.sh文件了老师,但是我在windows的命令窗口下该怎么输入命令啊?

windows我不熟,linux系统下直接sh就可以了
12313 发表于 Post on 2024-7-11 10:06:33
dayu8278 发表于 2024-7-11 08:05
#!/bin/bash

for i in `ls *.xpm`

我保存成.sh文件了老师,但是我在windows的命令窗口下该怎么输入命令啊?
dayu8278 发表于 Post on 2024-7-11 08:05:28
12313 发表于 2024-7-10 16:51
老师,我下载了链接中的plot_xpm.py脚本,然后在cmd中输入python plot_xpm.py gibbs.xpm,但是得到这样的 ...

#!/bin/bash

for i in `ls *.xpm`
do
    echo "Convert $i..."
    python plot_xpm.py $i
    if [[ "hbmap ss" =~ ${i/.xpm/} ]];then
        t=
    elif [[ "densmap rmsd residue" =~ ${i/.xpm/} ]];then
        t="-rainbow blue"
    else
        t="-rainbow red"
    fi
    # this is for windows platform
    ./gmx_xpm2ps.exe -f $i -o ${i/.xpm/}.eps $t > /dev/null 2>&1
done


你保存成.sh文件,然后运行下
sobereva 发表于 Post on 2024-7-10 23:14:23
12313 发表于 2024-7-10 16:51
老师,我下载了链接中的plot_xpm.py脚本,然后在cmd中输入python plot_xpm.py gibbs.xpm,但是得到这样的 ...

我没用过,在相应帖子里问
wangs 发表于 Post on 2024-7-10 16:15:30
DuIvyTools
sobereva 发表于 Post on 2024-7-10 15:24:08

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2026-2-28 03:53 , Processed in 0.173115 second(s), 25 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list