300多个原子，B3LYP结合2-zeta基组用Gaussian在像样的双路服务器上对此体系优化能算得动，只不过时间很长而已。不重要的地方可以用更小的基组节约耗时（混合基组。另外，当前情况氢根本没必要带极化）。虽然改用ORCA靠纯泛函做优化每一步会更快，但是之后振动分析耗时巨高，而且优化达到同样收敛限所需要的步数很可能明显更多。

如果仅仅需要优化结构而之后不需要做振动分析，用scf=conver=7结合opt=loose能节约优化过程可能一半的时间。

对于C、O等，6-31G**和def2-SVP耗时基本没差别，甚至后者的原高斯函数还更少一丁点，明显 “尝试使用更小的基组，C、H、O使用6-31G**基组” 是错误的描述。

你要不要试试先用半经验方法初步优化，然后在用orca，这么大的体系orca要快很多