gmx运行rerun无法得到LJ-SR和Coul-SR

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发布时间: 2024-7-12 11:02

各位老师，我的体系是模拟蛋白1和蛋白2在Mg2+的影响下的互作问题。其中蛋白1和蛋白2从整体看都是带负电的蛋白质，Mg2+是正电，所以Mg与蛋白应该是具有很强的静电吸引，二者的Coul-SR应该为正。按照卢老师 ...

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sobereva 发表于 Post on 2024-7-12 13:41:35

仔细检查索引文件里的序号确保无误。如果无误，改成gromacs 2018.8结合cutoff-scheme = group再试

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