求助，运行时间超过24h，请各位大神帮忙看看是任务提交的不正确吗？

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发布时间: 2024-7-12 11:19

新手第一次学习dalton，在超算中心装的软件，sob老师在论坛给的例子NH3BF3跑了11分钟跑完了，跑自己的分子时候已经超过24h，实时文件中产生的HALF1.DA和HALF3.DA都超过150G，但实时的.out文件已经12个小时没有动过了 ...

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luckyfengfeng 发表于 Post on 2024-7-26 22:02:42

yufengerfei 发表于 2024-7-26 19:00
我感觉我用的服务器应该和你是一个，你让技术员给你处理下并行就可以

好的，已经解决了，万分感谢

yufengerfei 发表于 Post on 2024-7-26 19:00:17

luckyfengfeng 发表于 2024-7-26 11:57
谢谢您的回复，我看网上有的体系并行容易出错，因为第一次算所以单线程跑的，现在这个任务已经跑了10几天 ...

我感觉我用的服务器应该和你是一个，你让技术员给你处理下并行就可以

luckyfengfeng 发表于 Post on 2024-7-26 11:57:03

yufengerfei 发表于 2024-7-26 02:04
NH3BF3跑了11分钟有点慢，应该没有用上并行，你的out文件中Compilation information下的MPI后面是off的。正 ...

谢谢您的回复，我看网上有的体系并行容易出错，因为第一次算所以单线程跑的，现在这个任务已经跑了10几天了还没有报错和停下的趋势，感觉好不正常
还有一个小问题想请教您，我们是在超算中心提交的，并行的话是这里的N改为更大的数值吗?"#SBATCH -N 1",多节点运行排队时间有点长

yufengerfei 发表于 Post on 2024-7-26 02:04:43

NH3BF3跑了11分钟有点慢，应该没有用上并行，你的out文件中Compilation information下的MPI后面是off的。正常32核的话可能几秒钟就跑完了。

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