求助GROMACS计算相互作用能时TMP对其他所有分子之间的静电力都是0

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发布时间: 2024-7-22 11:50

使用gromacs对体系进行了10ns的平衡模拟以及30ns的产生相模拟后，采用rerun再次模拟进行相互作用能的计算，完成后使用gmx energy 命令进行能量分析，发现该体系中TMP这一类型的分子对其他所有分子之间的静电力都是0 ...

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低调的板凳 发表于 Post on 2024-7-22 13:10:14

检查输入文件TMP类型分子的原子电荷，看上去像是用了全部为0的原子电荷

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