使用gmx rms计算蛋白配体复合物的RMSD值，在最小二乘和计算类型的组别该如何选择？

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发布时间: 2024-7-25 22:09

各位老师好，我的体系是蛋白配体复合物，模拟完成后，使用gmx rms命令想要计算复合物的RMSD值，并且在命令中已经引入-n index，那在之后的最小二乘和计算类型的组别该如何选择？

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12313 发表于 Post on 2024-7-27 13:45:31

sobereva 发表于 2024-7-26 23:38
是

好的，谢谢老师

sobereva 发表于 Post on 2024-7-26 23:38:40

12313 发表于 2024-7-26 12:30
最小二乘叠合和计算类型都选Protein_MOL吗？老师

是

12313 发表于 Post on 2024-7-26 12:30:27

sobereva 发表于 2024-7-26 04:01
既然明确是蛋白质-复合物作为一起算RMSD，明显是选Protein_MOL

最小二乘叠合和计算类型都选Protein_MOL吗？老师

sobereva 发表于 Post on 2024-7-26 04:01:53

既然明确是蛋白质-复合物作为一起算RMSD，明显是选Protein_MOL

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