本帖最后由 白丝赛高！ 于 2025-1-2 23:01 编辑 KCM@SHU 发表于 2024-12-7 13:54 另外关于收敛还有一点，似乎和固定层间距有关系。这种二维材料一般优化结构的时候，应力往往是集中在原子的Z方向的，而我们因为固定层间距的需求，应该是要把z方向的位移限制住的，所以导致原子只能在平面内优化，优化效率很慢。优化后的结构有点“层错”的感觉。如果做一个粗糙的预计算，可以试试直接把两层都固定住了看看PMS怎么变化，我就是用这样的方法算不同的模型以及对应的的断键情况的，可以节约很多时间。把pms计算完了之后再把其他结构逐步放开去优化，这样更容易收敛。 |
本帖最后由 白丝赛高！ 于 2025-1-2 23:04 编辑 KCM@SHU 发表于 2024-12-7 13:54 我没收敛，不过我能算出来S-O断键和O-O断键两种情况。这块的问题很复杂。首先，pms本身电性的处理，有处理成中性基态的，有补偿电荷的。你看zzh老师他们课题组，全是做成电中性分子处理的，我看了三四篇全是的。代表的是Nature Communications, 2022, 13(1): 4010.这篇NC,pms里面S-O键初始都1.9埃米了，然后再说S-O键在反应过程中被拉长-断裂。再比如这篇ACS ES&T的综述里面（ACS ES&T Engineering, 2023, 4(1): 19-46.），又有很多是电负性处理的，这个时候大多断的是O-O键。另外我看你做的也是单原子催化PMS，这块我也有个问题想请教你。我试过把pms当初电负性分子来算，吸附好像能很容易算成正的，反而当初电中性分子，基本上就是-1.7--2.2ev之间，挺符合文献的，不知道你是不是也这样。总之pms这个东西做起来挺麻烦的，还有限域的时候要固定层间距，如何固定层间距以及是否合理又是问题。如果有兴趣接着讨论的话，欢迎加我vx：Lapis0108 |
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白丝赛高！ 发表于 2024-12-2 22:53 我感觉限域优化好像就是会奇奇怪怪断键，你达到收敛了吗？我看了好几篇文献，他们限域优化好像力设定的比较高，要么就是用从头算动力学算的 |
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你好，我也遇到类似的问题，但是我断的是S-O键，反而不是O-O键，很奇怪 |
Yaohaohao 发表于 2024-8-15 14:35 没有,你在优化什么构型呢，我这个断键好像是合理的，只是没有达到力的收敛，我还在尝试 |
| 你好，请问解决了吗，我也是在结构优化时分子发生断键 |
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