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求助:Gromacs统计数量密度怎么从盒子中心开始啊

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xjw
发布时间: 2024-7-28 08:57

正文摘要:

各位老师,我在做气液界面的时候,想从盒子中心点开始统计各个组分的分布,如下图,但是gmx density好像只能从某个坐标轴开始,请问下图是怎么实现的啊?

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xjw 发表于 Post on 2024-7-29 09:49:46
sobereva 发表于 2024-7-29 03:18
自己写VMD tcl脚本等方式统计。GROMACS没对应的命令

北京科音分子动力学与GROMACS培训班(http://www.ke ...

收到,谢谢老师
sobereva 发表于 Post on 2024-7-29 03:18:42
自己写VMD tcl脚本等方式统计。GROMACS没对应的命令

北京科音分子动力学与GROMACS培训班(http://www.keinsci.com/workshop/KGMX_content.html)专门有一节非常系统、详细讲了VMD tcl脚本的编写并给出了巨量的例子。下面是课上用于类似问题的脚本




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