使用gromacs模拟蛋白配体体系时，关于配体限制势文件在topol.top的位置问题？

查看数: 1043 | 评论数: 3 | 收藏 Add to favorites 0

关灯 | 提示：支持键盘翻页<-左右->

发布时间: 2024-7-29 16:29

本帖最后由 12313 于 2024-7-29 16:31 编辑各位老师好，我要模拟的体系是蛋白配体复合物体系，配体是多肽小分子，我使用pdb2gmx命令，通过输入配体和受体蛋白的pdb文件，分别产生了各自的gro、itp ...

回复 Reply

12313 发表于 Post on 2024-10-5 09:46:58

wys 发表于 2024-10-4 13:19
你好，我也遇到了这个问题，请问你是怎么解决的呢？

复合物作为一个蛋白整体进行所有操作。不要对受体和配体分别进行gmx pdb2gmx操作

wys 发表于 Post on 2024-10-4 13:19:11

你好，我也遇到了这个问题，请问你是怎么解决的呢？

12313 发表于 Post on 2024-7-29 21:31:22

已解决

		自动登录 Automatic login	找回密码 Forget password
密码 Password			注册 Register