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运行了100纳秒的程序,为什么RMSD、Rg等数据没有算到100纳秒

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发布时间: 2024-7-31 10:57

正文摘要:

我模拟运算的时间是100纳秒,当我计算RMSD Rg等数据时,并没有算到100纳秒,算到大概80纳秒就停止了,这是为什么呢?我的计算命令:gmx rms -s md.tpr -f md_mol.xtc -o rmsd -tu ns以及gmx gyrate -s md.tpr -f md_ ...

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sobereva 发表于 Post on 2024-8-1 06:35:32
用gmx check检查当前轨迹到底有多长
Seyilaxa 发表于 Post on 2024-7-31 12:10:18
看看轨迹文件里是否包含100 ns?

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