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如何比较一个化合物两种结构的能量高低

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发布时间: 2024-7-31 17:11

正文摘要:

需要计算的这个化合物有Z、E两种构型(如图例)。想通过理论计算比较一下这两个构型的能量高低,是否可以用Gaussian 09在b3pw91/6-31g(d,p)下进行opt+freq计算,最后比较两个构型的能量?

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sobereva 发表于 Post on 2024-8-23 09:05:58
hyh10029 发表于 2024-8-22 15:37
老师您好,所计算的这个化合物有顺反异构两种构型,相比较下这两个构型哪个更稳定

用Shermo算自由能并对比。另外,对于互变势垒不是特高的情况,还可以通过deltaG=-RTlnK的关系计算两种构型在热平衡状态下的平衡常数
hyh10029 发表于 Post on 2024-8-22 15:37:21
sobereva 发表于 2024-8-21 12:03
语义不明
说清楚是异构化过程的自由能变化还是自由能垒

老师您好,所计算的这个化合物有顺反异构两种构型,相比较下这两个构型哪个更稳定
sobereva 发表于 Post on 2024-8-21 12:03:20
hyh10029 发表于 2024-8-21 10:29
谢谢老师,用Gaussian 09如何计算一个化合物顺反异构的自由能呢

语义不明
说清楚是异构化过程的自由能变化还是自由能垒
hyh10029 发表于 Post on 2024-8-21 10:29:15
sobereva 发表于 2024-8-2 03:51
怎么算自由能下文写明了
使用Shermo结合量子化学程序方便地计算分子的各种热力学数据
http://sobereva. ...

谢谢老师,用Gaussian 09如何计算一个化合物顺反异构的自由能呢
sobereva 发表于 Post on 2024-8-2 03:51:22
hyh10029 发表于 2024-8-1 17:03
老师您好,请问用自由能应该怎么计算呢?做两个构型相互转换的过渡态吗

怎么算自由能下文写明了
使用Shermo结合量子化学程序方便地计算分子的各种热力学数据
http://sobereva.com/552http://bbs.keinsci.com/thread-17494-1-1.html

你的提问前后无关
hyh10029 发表于 Post on 2024-8-1 17:03:48
sobereva 发表于 2024-8-1 06:22
没完整结构信息没法推荐计算级别,至少用b3pw91/6-31g(d,p)级别的能量根本发不出去文章、能量差较小的情况 ...

老师您好,请问用自由能应该怎么计算呢?做两个构型相互转换的过渡态吗
sobereva 发表于 Post on 2024-8-1 06:22:30
没完整结构信息没法推荐计算级别,至少用b3pw91/6-31g(d,p)级别的能量根本发不出去文章、能量差较小的情况下判断的可信度极低。而且注意用自由能比较比起用电子能量比较更有实际意义
chands 发表于 Post on 2024-7-31 18:59:46
理论上是可以在同一级别比较能量,但是这两个构型的能量差可能很小,建议优化后用更高级别算单点能。
B3pw91很少用,个人觉得用B3LYP就行(如果基团有弱相互作用加色散校正)。

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