关于判断蛋白配体复合物模拟50ns后的RMSD曲线平衡问题

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发布时间: 2024-8-1 13:32

各位老师好，我的体系是蛋白配体复合物，在进行了50ns的模拟时长后，计算得到的RMSD曲线如图所示，想问一下可以判断该体系在20ns之后达到平衡吗

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12313 发表于 Post on 2024-8-2 14:05:28

sobereva 发表于 2024-8-2 03:58
一般来说可以。但也应肉眼观看轨迹（包括多帧叠加方式显示）确认45ns后没显著结构变化

谢谢老师

sobereva 发表于 Post on 2024-8-2 03:58:24

一般来说可以。但也应肉眼观看轨迹（包括多帧叠加方式显示）确认45ns后没显著结构变化

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