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求助:使用了trjconv后，配体小分子分子还是在盒子外

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lzy233

发布时间: 2024-8-3 09:08

正文摘要:

本帖最后由 lzy233 于 2024-8-3 09:10 编辑我正在做配体+蛋白复合物的分子动力学模拟，结束后我按照以下方式处理 gmx trjconv -s md.tpr -f md.xtc -o md_noPBC.xtc -center -pbc mol -ur compact -n index.ndx ...

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Seyilaxa 发表于 Post on 2024-8-3 14:29:40

第二步应该把蛋白或者复合物居中

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