卡开发发 发表于 2025-4-8 18:12 好的，谢谢老师 |
11223 发表于 2025-4-8 08:58 比较严格的做法需要确定过渡态连接你对应反应的反应物和产物，同时过渡态结构只有一个虚频以及梯度（力）足够小，一般LST/QST很难直接找到过渡态，而且它的收敛标准和结构优化的也不一样，用的是RMS Force而不是Max Force。一般推荐猜得到过渡态结构可以直接算频率，猜不到可以用LST/QST进行初步的搜索（并计算频率），然后进行TS opt。但是MS这里设计矛盾的点在于TS confirm事实上只能针对LST/QST的轨迹而不是TS opt，这就必须另想办法。 |
卡开发发 发表于 2025-4-8 06:31 好的，谢谢老师回答，麻烦还有一个问题就是在dmol3里用LST/QST搜索到过渡态后，验证有一个虚频并且是指向反应方向的是不是就可以确定是过渡态了，如果不可以确定，还需要做什么 |
11223 发表于 2025-4-7 10:14 有可能会影响到LST过程，最终导致得到的结构可能会有点差别，因为通常LST/QST的收敛会比较宽松。但毕竟这种方法只是提供初猜，所以问题不是很大。 |
卡开发发 发表于 2016-12-22 20:52 请问老师在reaction preview时，帧数的不同有什么影响 |
卡开发发 发表于 2016-12-23 13:03 好的，谢谢您了。 |
lwj 发表于 2016-12-23 10:49 过渡态确认就是NEB方法做IRC，不过使用的轨迹是你搜索过渡态的轨迹而非精修过程的信息，要保证势能面的一致性，原则上精度肯定得一致。 |
| 参与人数Participants 1 | eV +1 | 收起 理由Reason |
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本帖最后由 lwj 于 2016-12-23 10:58 编辑 卡开发发 发表于 2016-12-22 20:52 老师，我看教程里没有进行过渡态确认，实际计算中这个操作重要吗？过渡态确认的精度是否需要和精修过渡态一致？ |
卡开发发 发表于 2016-12-22 20:52 好的，谢谢老师。 |
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1、2、建议精度还是用到Fine吧，但LST/QST的收敛标准不见得要采用Fine的标准，Medium就够了，那个收敛标准对于找过渡态确实太严格了，LST/QST其实只是相当于对过渡态做个初猜，过渡态精修的时候调整回Fine的精度就行。 3（对应4#）、影响能量的因素不仅只是k点、截断半径这两个因素，基组和多极展开、smearing、积分精度等都有影响，所以选择的时候务必要慎重，并非只是Medium和Fine这样，必要的话k点等还是要做个测试的，必要的话可能还得做gradient方面的测试。这些参数实际上影响的不仅是能量，还会影响到Force和Hessian。 |
| 参与人数Participants 2 | eV +6 | 收起 理由Reason |
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| + 4 | 谢谢老师 |
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| + 2 |
本帖最后由 lwj 于 2016-12-22 20:29 编辑 zyj19831206 发表于 2016-12-22 12:27 是同一个，不同的是使用计算精度 |
| 两个曲线都是同一个反应？ |
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