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在mof骨架中插入二亚胺配体的限制性优化问题

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发布时间: 2024-8-21 14:46

正文摘要:

本人想要在UiO-68中插入二亚胺体系,通过二亚胺结构中的羰基上的氧原子实现与MOF金属团簇的连接。 均相的二亚胺体系在优化后O原子不位于同一个平面上,如图1.jpg 插入MOF后二亚胺分子的振动带动团簇的振动,导致团 ...

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squirrelS 发表于 Post on 2024-8-22 15:12:40
sobereva 发表于 2024-8-22 10:38
用不用赝势跟这个是两码事。赝势基组和全电子基组都可以用

对于单一的二亚胺体系,直接放开了优化

是的老师 我目前对单一二亚胺体系是完全放开优化的,包括后续反应Mo Ts的计算也已经完成了。
按照我理解的您的意思,二亚胺插入配体固定Zr原子优化是合理的,我能继续这样算是吗?
sobereva 发表于 Post on 2024-8-22 10:38:16
squirrelS 发表于 2024-8-22 10:15
感谢sob老师 我的目的是想用单一的二亚胺体系做一下同样的反应能垒的计算,和负载之后的非均相结构的反应 ...

用不用赝势跟这个是两码事。赝势基组和全电子基组都可以用

对于单一的二亚胺体系,直接放开了优化
squirrelS 发表于 Post on 2024-8-22 10:22:31
imasen 发表于 2024-8-22 02:32
你的mof金属团簇部分结构是有问题的,其中一个配位的羧基在你这里被画成一个水加一个氢氧根了。

是的是的 忘了用甲酸根封端了 感谢提醒
squirrelS 发表于 Post on 2024-8-22 10:15:23
sobereva 发表于 2024-8-22 01:36
纠结单个二亚胺优化成什么样没意义,连接上UiO-68之后照样还得重新优化

感谢sob老师 我的目的是想用单一的二亚胺体系做一下同样的反应能垒的计算,和负载之后的非均相结构的反应能垒做一下对比。
我纠结的点就是我目前做的这种限制性优化是否合理呢?
如果合理的话 我在优化固定Zr原子的条件下优化结构加了Zr的赝势基组是否就没有意义了呢?
imasen 发表于 Post on 2024-8-22 02:32:59
你的mof金属团簇部分结构是有问题的,其中一个配位的羧基在你这里被画成一个水加一个氢氧根了。
sobereva 发表于 Post on 2024-8-22 01:36:38
纠结单个二亚胺优化成什么样没意义,连接上UiO-68之后照样还得重新优化

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