[5+2]环加成过渡态搜索，分步或协同机理的问题

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发布时间: 2024-8-24 20:15

本帖最后由 Chemy 于 2024-8-25 19:03 编辑各位老师好，最近在寻找类似Houk这篇文章中[5+2]环加成反应的过渡态(如图)，他们能够找到“concerted but asynchronous”的协同机理的过渡态，然而在我的底物下却始终 ...

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Chemy 发表于 Post on 2024-9-4 19:36:31

起个名字发表于 2024-9-4 09:31
我在网站上算了一下，可以参考，能一步形成产物：
https://alphacat.deepchem.cn/share#/detail/831d7b1dd ...

感谢回复，我重复了Houk的工作，能够完全重复出来。可能是我们这个体系的机理和他不同，导致找不到想要的过渡态

起个名字 发表于 Post on 2024-9-4 09:31:24

我在网站上算了一下，可以参考，能一步形成产物：
https://alphacat.deepchem.cn/sha ... 1f980a58208dcd03aea

lilf 发表于 Post on 2024-8-27 15:15:56

反应物不同，机理不同吧

yuyangzap 发表于 Post on 2024-8-26 13:46:25

保证计算方法严格一致重新算

Chemy 发表于 Post on 2024-8-25 18:59:43

wjc404 发表于 2024-8-25 17:51
Houk文章SI中的过渡态和IRC你能重复出来吗（原始复制它的XYZ去算opt=(ts,calcall,noeigen)能一步收敛，以及 ...

感谢回复，Houk文章中是用ORCA优化的过渡态，我没用过，准备学习一下，并重复他的结果。我的底物是羟基对苯醌作为5片段，缺电子双键作2片段，和他的差异不大。

wjc404 发表于 Post on 2024-8-25 17:51:10

本帖最后由 wjc404 于 2024-8-25 17:53 编辑

Houk文章SI中的过渡态和IRC你能重复出来吗（原始复制它的XYZ去算opt=(ts,calcall,noeigen)能一步收敛，以及跑IRC形状确实像图画的那样）？以及你的底物和他文章用的有哪些差异？

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