计算化学公社»论坛首页 › 理论与计算化学 (Theoretical and Computational Chemistry) › 分子模拟 (Molecular Modeling) › gromacs跑完nvt之后分子结构发生变化？

gromacs跑完nvt之后分子结构发生变化？

查看数: 836 | 评论数: 1 | 收藏 Add to favorites 0

关灯 | 提示：支持键盘翻页<-左右->

帖子模式

1367

发布时间: 2024-8-27 10:58

正文摘要:

各位老师同学好，我在跑nvt模拟的时候，分子结构发生了变化，其从直链结构变得有部分蜷缩起来了，但是在研究比结构更长的乙酸丁酯的时候，并没有这种情况，1.想问一下是什么原因导致的？2.我是否需要设置约束相关的 ...

回复 Reply

sobereva 发表于 Post on 2024-8-28 09:13:23

该什么样就什么样。本来动力学就是一种构象采样的手段，下文正是利用这一点来做构象搜索
使用molclus程序做团簇构型搜索和分子构象搜索
http://bbs.keinsci.com/thread-577-1-1.html
使用Molclus结合xtb做的动力学模拟对瑞德西韦(Remdesivir)做构象搜索
http://bbs.keinsci.com/thread-16255-1-1.html

		自动登录 Automatic login	找回密码 Forget password
密码 Password			注册 Register