gromacs 计算出的分子间相互作用能数据不对是什么原因

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发布时间: 2024-8-27 14:53

本帖最后由 Sunca 于 2024-8-27 17:24 编辑我的体系是10条糖链和水，10条糖链的组成完全相同，用rerun建立能量组计算得到的糖链之间的Coul-SR,发现第一条链跟其他链的Coul-SR值（mol1-mol2,mol1-mol3,.....mol1- ...

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sobereva 发表于 Post on 2024-8-28 09:09:06

首先先注意北京科音分子动力学与GROMACS培训班（http://www.keinsci.com/workshop/KGMX_content.html）的ppt里说的相关问题：

确保这些注意到了之后，取某单帧结构，将组间相互作用能的结果和结构图相对照，一点点弄清楚怎么回事

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