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进行位置限定时,原子序号发生变化

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发布时间: 2024-8-28 15:30

正文摘要:

我在进行位置限定时,根据em.gro里面的原子序号进行选择,并生成对应的限制.itp。后面就遇到了问题,因为我的蛋白是由三条链组成的,最开始pdb2gmx后会分别生成3条链的itp文件,里面的原子序号和整体蛋白的gro文件里 ...

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Willow0114 发表于 Post on 2024-8-28 19:47:04
sob老师,是从1开始计算吗?那我计算出来之后和itp如何对应呢?能否具体的讲一下
sobereva 发表于 Post on 2024-8-28 15:59:33
自己用计算器,算出来每个分子里面该限制的原子的序号

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