感谢，已经解决了

你可以试试这个：
set sel [atomselect top "(same residue as all within 10 of protein) and element Ca"]
如果还是0，可以打开VMD检查一下看看VMD有没有识别出来element（输入的PDB文件最后一列为空的时候VMD就识别不了element）。
识别不了element的时候建议用resname或者name来选择Ca，检查一下PDB文件里的Ca的残基名字和原子名字即可。