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IRI散点图spike未达到最底部是什么原因呢

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关于时间DE

发布时间: 2024-9-2 19:45

正文摘要:

同一个二聚体体系，两个不同的结合位点，第二个情况有spike没有到达最底部，能说明什么原因呢。

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sobereva 发表于 Post on 2024-9-4 11:39:00

关于时间DE 发表于 2024-9-3 18:16
收到，谢谢sob老师解答。还有一个问题，几个spike同属于vdW作用范围，spike对应横坐标值越负可以说明作用 ...

不能这么简单判断
一定要、必须要、绝对要结合等值面图，否则别人都不知道spike对应的作用特征，比如两个spike对应的作用的面积相差很多，那显然就不能光对比作用区域的电子密度判断强度。而且比如原子半径很大的离子的离子键作用区域也可能电子密度很小，spike位置接近0，但强度肯定比一般的范德华作用大得多。
光给出散点图根本什么用都没有

关于时间DE 发表于 Post on 2024-9-3 18:16:07

sobereva 发表于 2024-9-3 12:01
始终结合等值面图理解各个spike的含义。光给出个散点图毫无意义，没人猜得出来是什么情况
下文里也明确说 ...

收到，谢谢sob老师解答。还有一个问题，几个spike同属于vdW作用范围，spike对应横坐标值越负可以说明作用力越强吗

sobereva 发表于 Post on 2024-9-3 12:01:13

始终结合等值面图理解各个spike的含义。光给出个散点图毫无意义，没人猜得出来是什么情况
下文里也明确说了
用Multiwfn+VMD做RDG分析时的一些要点和常见问题
http://sobereva.com/291（http://bbs.keinsci.com/thread-1206-1-1.html）

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