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求助Amber拉伸分子动力学SMD输出文件中work的计算细节

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梅卡瓦

发布时间: 2024-9-3 20:42

正文摘要:

Amber在运行拉伸分子动力学SMD之后的结果文件会给出四列数据，分别为[size=9.9626pt]x[size=7.3723pt]0[size=9.9626pt]([size=9.9626pt]t[size=9.9626pt])[size=9.9626pt], [size=9.9626pt]x[size=9.9626pt], [size= ...

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梅卡瓦 发表于 Post on 2024-9-6 19:50:02

搞明白了，位移应该用牵引组的位置，试了下上式是对的，与Amber的实例文件可以对的上。

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